《变形金刚：超能勇士》将经典变形金刚宇宙拓展至史前时代。汽车人与霸天虎的漫长战争催生了后代阵营——巨无霸与原始兽，两大阵营的宿命对决意外穿越时空，降临在恐龙横行、危机四伏的史前地球。霸王龙为寻找新能源，带领原始兽发动时空跳跃，企图改写霸天虎战败的历史。擎天圣率领巨无霸紧随其后，展开追击。双方在原始丛林中反复拉锯，利用野兽形态与机械变形的双重优势激烈交锋，而早已盘踞此地的神秘外星人沃克人也因察觉到穿越者身上携带的未来信息而卷入混战，令战局更加扑朔迷离。战斗中，霸王龙意外发现坠毁在地球的汽车人战舰方舟号——那是改变历史的钥匙。为摧毁沉睡中的汽车人，使霸天虎在未来赢得胜利，霸王龙制定了疯狂计划。擎天圣与巨无霸必须不惜一切代价阻止阴谋，保护史前时空的平衡，更要在与原始兽的殊死搏斗中，揭开这场跨越时空战争背后真正的秘密。